Алгоритмы биоинформатики осень 2022 — различия между версиями
Apravko (обсуждение | вклад) (Новая страница: «= Общие сведения = Курс основан на MOOC «[https://www.coursera.org/specializations/bioinformatics '''Bioinformatics Algorithms, An Acti…») |
Apravko (обсуждение | вклад) (→Общие сведения) |
||
| (не показана 1 промежуточная версия этого же участника) | |||
| Строка 3: | Строка 3: | ||
* Расписание: ЧТ 10:45-12:10 528ГК | * Расписание: ЧТ 10:45-12:10 528ГК | ||
| − | |||
* [https://t.me/joinchat/U6rMF8QO6S7-83aD Телеграм-чат курса] | * [https://t.me/joinchat/U6rMF8QO6S7-83aD Телеграм-чат курса] | ||
* [https://yandex.zoom.us/j/96312576964?pwd=cWZnVHdjc21jaHh3ZVU1YXZMckxvQT09 '''Трансляция''']. | * [https://yandex.zoom.us/j/96312576964?pwd=cWZnVHdjc21jaHh3ZVU1YXZMckxvQT09 '''Трансляция''']. | ||
| Строка 69: | Строка 68: | ||
===== Сроки ===== | ===== Сроки ===== | ||
* После дедлайна решать задачи на странице Rosalind [https://rosalind.info/problems/list-view/?location=bioinformatics-textbook-track '''Bioinformatics Textbook-Track'''] | * После дедлайна решать задачи на странице Rosalind [https://rosalind.info/problems/list-view/?location=bioinformatics-textbook-track '''Bioinformatics Textbook-Track'''] | ||
| − | * Коды решений и сканы профилей присылать на почту bogdan.d@phystech.edu до ''12.12. | + | * Коды решений и сканы профилей присылать на почту bogdan.d@phystech.edu до ''12.12.2022''. |
== Экзамен == | == Экзамен == | ||
Текущая версия на 19:33, 26 ноября 2022
Содержание
Общие сведения
Курс основан на MOOC «Bioinformatics Algorithms, An Active Learning Approach»
- Расписание: ЧТ 10:45-12:10 528ГК
- Телеграм-чат курса
- Трансляция.
Темы
1. Где начинается репликация ДНК? (Алгоритмическая разминка, 2 недели)
2. Какие паттерны ДНК действуют как клеточные часы? (Жадные и случайные алгоритмы, 2 недели)
3. Как собирать геномы? (Графовые алгоритмы, 2 недели)
4. Как секвенировать антибиотики? (Алгоритмы грубой силы, 2 недели)
5. Как сравнивать биологические последовательности? (Алгоритмы динамического программирования, 2 недели)
6. Существуют ли хрупкие области в геноме человека? (Комбинаторные алгоритмы, 2 недели)
Преподаватели
- Богдан Давид, кафедра Алгоритмов и Технологий Программирования
- Авторы курса:
- Pavel Pevzner (University of California, San Diego)
- Phillip E. C. Compeau (University of California, San Diego)
Запись на курс
0. Выбор курса в Личном Кабинете
1. Регистрация на платформе Rosalind.info
2. Регистрация на курсе Bioinformatics Algorithms (FIVT_Bioinfo) 2022fall
3. Заполнение заключительной формы
Материалы
- Презентации.
- Записи занятий.
- Видеолекции.
- Coursera (темы 1-2).
- Coursera (темы 3-4).
- Coursera (темы 5-6).
- Textbook.
Задачи
https://rosalind.info/classes/926/
| Topic | Количество задач | Deadline |
|---|---|---|
| Topic 1 | 5 задач | 19.09.2022 |
| Topic 2 | 5 задач | 03.10.2022 |
| Topic 3 | 5 задач | 17.10.2022 |
| Topic 4 | 5 задач | 31.10.2022 |
| Topic 5 | 5 задач | 14.11.2022 |
| Topic 6 | 5 задач | 28.11.2022 |
Сроки
- После дедлайна решать задачи на странице Rosalind Bioinformatics Textbook-Track
- Коды решений и сканы профилей присылать на почту bogdan.d@phystech.edu до 12.12.2022.
Экзамен
- Оценка = N / 3 * 0.8 + Т * 0.2
N – количество решенных задач
T – активность на занятиях
