Алгоритмы биоинформатики осень 2023 — различия между версиями
(Новая страница: «= Общие сведения = Курс основан на MOOC «[https://www.coursera.org/specializations/bioinformatics '''Bioinformatics Algorithms, An Acti…») |
(→Общие сведения) |
||
| Строка 1: | Строка 1: | ||
= Общие сведения = | = Общие сведения = | ||
Курс основан на MOOC «[https://www.coursera.org/specializations/bioinformatics '''Bioinformatics Algorithms, An Active Learning Approach''']» | Курс основан на MOOC «[https://www.coursera.org/specializations/bioinformatics '''Bioinformatics Algorithms, An Active Learning Approach''']» | ||
| + | * Расписание: уточняется | ||
| + | * Семестр: 9 (пятый курс) | ||
| + | * Форма контроля: экзамен | ||
| − | + | == Важные ссылки == | |
* Телеграм-чат курса | * Телеграм-чат курса | ||
* Трансляция | * Трансляция | ||
Версия 17:11, 18 апреля 2023
Содержание
Общие сведения
Курс основан на MOOC «Bioinformatics Algorithms, An Active Learning Approach»
- Расписание: уточняется
- Семестр: 9 (пятый курс)
- Форма контроля: экзамен
Важные ссылки
- Телеграм-чат курса
- Трансляция
Темы
1. Где начинается репликация ДНК? (Алгоритмическая разминка, 2 недели)
2. Какие паттерны ДНК действуют как клеточные часы? (Жадные и случайные алгоритмы, 2 недели)
3. Как собирать геномы? (Графовые алгоритмы, 2 недели)
4. Как секвенировать антибиотики? (Алгоритмы грубой силы, 2 недели)
5. Как сравнивать биологические последовательности? (Алгоритмы динамического программирования, 2 недели)
6. Существуют ли хрупкие области в геноме человека? (Комбинаторные алгоритмы, 2 недели)
Преподаватели
- Богдан Давид, кафедра Алгоритмов и Технологий Программирования
- Авторы курса:
- Pavel Pevzner (University of California, San Diego)
- Phillip E. C. Compeau (University of California, San Diego)
Запись на курс
0. Выбор курса в Личном Кабинете
1. Регистрация на платформе Rosalind.info
2. Регистрация на курсе Bioinformatics Algorithms (FIVT_Bioinfo) 2023fall 3. Заполнение заключительной формы
Материалы
- Презентации
- Записи занятий
- Видеолекции.
- Coursera (темы 1-2).
- Coursera (темы 3-4).
- Coursera (темы 5-6).
- Textbook.
Задачи
https://rosalind.info/classes/926/
| Topic | Количество задач | Deadline |
|---|---|---|
| Topic 1 | 5 задач | 00.09.2023 |
| Topic 2 | 5 задач | 00.10.2023 |
| Topic 3 | 5 задач | 00.10.2023 |
| Topic 4 | 5 задач | 00.10.2023 |
| Topic 5 | 5 задач | 00.11.2023 |
| Topic 6 | 5 задач | 00.11.2023 |
Сроки
- После дедлайна решать задачи на странице Rosalind Bioinformatics Textbook-Track
- Коды решений и сканы профилей присылать на почту bogdan.d@phystech.edu до 00.12.2023.
Экзамен
- Оценка = N / 3 * 0.8 + Т * 0.2
N – количество решенных задач
T – активность на занятиях
